1 - Pra grava aqui no meu pc via usb que programa eu uso? 

Eu recomendo o Reaper, mas é uma DAW bem complexa. Um program simples e prático é o Audacity.

2 - Tem como gravar  um contra baixo ligado na entrada auxiliar   ou outro instrumento ?

Sim é possível gravar um contra-baixo, tem alguns patches no custom tone para contra-baixo.

Outra coisa, se você realmente quer aprender, leia todo o manual, vai sanar todas essas suas dúvidas.

ps.: O forum em portugues aqui no site da line 6 é meio abandonado, o que é uma pena, mas existe um comu no orkut e um grupo no face nos quais a galera ajuda bastante, segue abaixo os links.

http://www.facebook.com/#!/groups/125300997564439/

http://www.orkut.com.br/Main#Community?cmm=105693847